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实验动物金黄色葡萄球菌微滴式数字PCR检测方法建立和优化
2025年05月16日
来源:中国实验动物学报2025年第3期
作者:李钰钰 姚继英 田永路 孙甜甜 韦玉生 李夏莹
责任编辑:lascn
摘要:建立一种快速、准确的微滴式数字 PCR(droplet digital PCR,ddPCR)检测方法,用于检 测实验动物和环境中的金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus,SA)。
目的 建立一种快速、准确的微滴式数字 PCR(droplet digital PCR,ddPCR)检测方法,用于检 测实验动物和环境中的金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus,SA)。
方法 针对 SA 耐热核酸酶基因(nuc)的 保守区域,设计并合成一对特异性引物和探针,通过实验优化,确定最佳反应条件,检测动力学范围,验证该方 法的特异性和方法再现性;以相同的模板分别进行 ddPCR 和实时荧光定量 PCR(qPCR)方法反应,检测两种 方法的互换性;最后将该方法用于各种临床样品的检测。
结果 建立的 SA ddPCR 方法的动力学范围为 100 ~ 15 000 copies/ μL,检测极限为 2. 5 copies,定量极限为 10 copies;检测该方法的特异性,结果仅 SA 有阳性微 滴,其他病原体均无阳性微滴;对 3 个平行样本进行测量后,计算得到其标准偏差与相对标准偏差发现,在 ddPCR 的动力学检测区间内,随着目标拷贝数的逐渐降低,相对标准偏差呈现上升趋势,然而始终低于 25% 的,这一结果表明该检测方法具有良好的稳定性。 t 检验分析 ddPCR 和 qPCR 方法的检测结果,显示两种方 法所得拷贝数均无明显差异。 共检测 10 份临床样本,有 2 份临床样本为阳性,其他均为阴性,该结果与 qPCR 检测结果一致。
结论 建立的检测 SA 的 ddPCR 方法灵敏度高、特异性强、稳定性好和重复性好,可用于实验 动物 SA 的检测。
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